在偏僻的小村庄——雏见泽村过着愉快生活的少年前原圭一，得知了在这和平村庄中发生的分尸杀人案件。而此事件，又与被称为「御社神的作祟」的一连串离奇死亡案件有所关联。

　　

故事发生在遥远的未来，彼时，大陆板块的活动令海水渐渐淹没了日本的大部分国土，人们不得不在海上建造起新的都市。随着时间的推移，海上都市的规模越来越大，航路越来越复杂，为了维持秩序，一种人们称之为“蓝色人鱼”的新型职业渐渐被大众所接收和憧憬，这份光荣的职业亦成为了很多女子高中生们未来奋斗的目标。